實時定量聚合酶鏈反應用于控制提取的核酸/cDNA和基因組DNA的質量。為評估所提取的核糖核酸的質量,可建立一種特異性的單拷貝基因系統,用以量化基因組當量和細胞數。而該系統用于對DNA質量控制的概要,使用該系統針對單拷貝基因,使用ct值來確定某些組織的DNA提取質量。超過一定閾值的樣本表明dna已經被降解,需要重新獲取,而利用系統可對偽基因進行靶向復制。
在準備研磨提取前,我們需要取新鮮的動物組織做樣品,剪切成50-100mg左右的濕重,用液氮快速冷凍,在-80℃的低溫冰箱中保存。這些被冷凍的組織在DNA提取前,需被放在深孔板中,然后把深孔板放在干冰上進行冷凍。每個孔中需加入研磨鋼珠和緩沖液,使其凈化溶解。用高通量的研磨儀器將其深孔蓋密封,開始研磨提取。
在50℃下樣品進行逆轉錄反應,需加入60微升水,加熱5分鐘至95℃,在冰上進行冷卻,使反應終止。而樣品提取的DNA質量是由ct值決定的,是受內源受控的。待超過某一閾值時,樣品質量會受到影響,RNA總降解,需要再次提取備用樣品。通常用該系統來評DNA的質量,其目標是具有特定物種的甘油醛-3-磷酸脫氫酶或核糖體基因。
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本文關鍵詞:研磨儀,研磨器,上海冉繪